华南海鲜市场不是新冠病毒发源地。如今,这一推论又有了新的有力证据。
据中国科学院西双版纳热带植物园官方网站消息,其联合华南农业大学和北京脑科中心的科研人员一起收集了覆盖了四大洲12个国家的93个新型冠状病毒样本的基因组数据(截至2月12日),通过全基因组数据解析,追溯传染源及扩散路径。
研究发现,华南海鲜市场的新型冠状病毒是从其它地方传入进来,在市场中发生快速传播蔓延到市场之外;且新型冠状病毒在2月12日之前,发生过2次明显的种群扩张,分别是12月8日和1月6日。
这一研究再次印证了华南海鲜市场不是病毒发源地的推论。
华南海鲜市场不是源头
随着新冠肺炎疫情的蔓延,寻找疫情的疫源地,确定病毒的来源,进而更加有效地防控新冠病毒,成为各方关注的焦点。
就在大家将“矛头”一致对准华南海鲜市场之际,1月24日,顶级医学期刊《柳叶刀》的一篇文章引起了轩然大波。
文中,研究人员分析了2019年12月16日至2020年1月2日期间在武汉市入院的首批41例确诊感染新冠病毒的病例。41个病人中,最早的在12月1日患病,且此病例没有武汉华南海鲜市场暴露史。同时,这41个确诊案例中,有13个病例与华南海鲜市场并无接触史。换句话说,病毒在进入海鲜市场之前就已经潜入武汉居民的生活中。
如今,快一个月过去,这一推论有了新的证据。
图为新型冠状病毒单倍型的样品采集时间情况。来源于中科院。红色圈的样品是确认与华南海鲜市场有关;蓝色圈的样本确认与海鲜市场无关。
此次,研究团队收到的93个样本包含58种单倍型(基因类型),可以归纳为五组:3个古老超级传播者单倍型(H1,H3和H13)和2个新的超级传播者单倍型(H56和mv2)。
演化关系显示,单倍型H13和H38是比较“古老的”单倍型,通过一个中间载体(mv1,可能是祖先单倍型,也可能是来自中间宿主或“零号病人”)与蝙蝠冠状病毒RaTG13关联,并通过单倍型H3衍生出单倍型H1。
研究人员发现,与华南海鲜市场有关联的患者,其样品单倍型都是H1及其衍生的单倍型H2,H8-H12,而一份武汉样品单倍型H3与华南海鲜市场无关。
“可见,华南海鲜市场的新型冠状病毒是从其它地方传入进来,在市场中发生快速传播蔓延到市场之外。另外,根据病患发病时间记录和种群扩张时间推断,也印证了华南海鲜市场不是病毒发源地的推论。”研究团队称。
“确定华南海鲜市场是不是唯一的发源地,对于寻找病毒的来源,以及确定中间宿主,对疫情的控制和避免再次爆发具有至关重要的意义。”研究团队表示。
11月下旬可能已有人际传播
根据新型冠状病毒基因组数据,研究团队推算1月之前的种群扩张发生时间是12月8日,该结果暗示病毒可能在12月初,甚至11月下旬即已经开始有人际传播,随后在华南海鲜市场加快了人际传播。
研究团队推算2月份之前的种群扩张时间在1月6日,这个可能与元旦假期有关联。
病毒基因组尚未发生重组事件
研究团队对“古老的”单倍型H13和H38的病毒样品溯源发现,他们分别是来自深圳的病患(广东首例)和美国华盛顿州的病患(美国首例)。他们的旅行记录表明应该都是2019年12月底至2020年1月初在武汉探亲期间被感染的。但现有武汉样本中没有检测到H13和H38单倍型。
研究团队分析,这可能是因为现有样品主要采自几家定点医院,而且样品采集时间局限于2019年12月24日和2020年1月5日。
研究人员认为,如果能在武汉其它医院早期的病患检测到这两种单倍型,将对于寻找病毒来源非常有帮助。
根据研究团队的分析,广东的病毒可能有三个来源,重庆和台湾的病毒有两个来源。其中,广东深圳一家人在早期就通过人传人进行了传播。
有较多样本的澳大利亚、法国、日本和美国,他们的患者感染源至少有两个,尤其是美国包括了五个来源。
新型冠状病毒58种单倍型的演化关系和地理分布格局(A,B),单倍型之间的可能演化关系(C),以及新型冠状病毒的可能传播和扩散路线(D)。A和B圆圈中的数据是样本数量。
非常值得关注的是,H56这个超级传播者单倍型,它同时是澳大利亚、法国和美国,以及我国台湾患者的传染源。
研究团队还发现,新型冠状病毒基因组尚未发生重组事件。
来源:经济日报经点科学工作室
来源:经济日报
原文链接:
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编辑:海明威
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